در تاریخ ۱۳ مهر ۱۳۸۹ توسط نیروهای وزارت اطلاعات جمهوری اسلامی ایران در شهرستان سردشت استان آذربایجان غربی بازداشت شد. او به مدت ۲۳۰ روز در سلول انفرادی بازداشتگاه‌های امنیتی سردشت، سقز و سنندج تحت بازجویی و شکنجه‌های شدید قرار گرفت.
خانواده‌ تا مدت‌ها از محل نگهداری و وضعیت او هیچ اطلاعی نداشتند و وزارت اطلاعات نیز در ابتدا منکر بازداشت وی شده بود.

در تاریخ ۲۴ اسفند ۱۳۸۹ از سوی دادگاه انقلاب اسلامی سقز به اتهام «محاربه»^۱ از طریق عضویت در حزب کومله زحمتکشان کردستان^۲ به ۳۰ سال حبس توام با تبعید به زندان میناب محکوم شد.

وی همچنین در دو پرونده در سال‌های ۱۳۸۷ و ۱۳۹۰ با اتهام «تردد غیرمجاز از مرزهای کشور» به پرداخت صد هزار تومان جزای نقدی در حق صندوق دولت و یک سال حبس تعزیری محکوم شد.

مطلب احمدیان  چند سال اول حبس را در زندان‌های سقز و سنندج گذراند و هم‌اکنون در زندان اوین به به سر می‌برد. وضعیت جسمی او به دلیل شکنجه‌های شدید در دوران بازداشت و با توجه به ابتلا به بیماری‌های متعدد از جمله «عفونت بیضه» و «سرطان اثنی‌عشر» در دوران سخت حبس، وخیم و نگران‌کننده است. این در حالی است که علی‌رغم نظر پزشکان و نیاز مبرم  به درمان در خارج از زندان، نهادهای امنیتی و مسئولان زندان از اعطای مرخصی استعلاجی خودداری می‌کنند.

شهریور ۱۳۹۷ ـ از زندان مرکزی سنندج به زندان اوین انتقال یافت.

اواسط سال ۱۳۹۸ ـ از زندان اوین به زندان رجایی‌شهر کرج منتقل شد.

۱۱ مرداد ۱۴۰۲ ـ به دنبال تعطیلی زندان رجایی‌شهر به همراه تعدادی دیگر از زندانیان سیاسی به زندان اوین انتقال یافت.

دی ۱۳۹۸ ـ با انتشار نامه‌ای از داخل زندان در مورد وضعیت وخیم جسمی و سلامتی خود و بیماری‌هایی که در دوران بازداشت و زندان به آنها مبتلا شده، توضیحاتی ارائه داد.

۱. ماده ۲۷۹ قانون مجازات اسلامی: «محاربه، عبارت از کشیدن سلاح، به قصد جان، مال یا ناموس مردم یا ارعاب آنها است، به نحوی که موجب ناامنی در محیط گردد. بر اساس ماده ۲۸۲ قانون مجازات اسلامی، چنانچه شخصی، مرتکب جرم محاربه شود، به انتخاب قاضی، به صلب، اعدام، قطع دست راست و پای چپ یا نفی بلد، محکوم خواهد شد.»

۲. سازمان انقلابی زحمتکشان کردستان ایران معروف به «کومله» به عنوان یک سازمان مارکسیست ـ لنینیستی با گرایشات مائوئیستی پس از نزدیک به یک دهه فعالیت مخفیانه، همزمان با پیروزی انقلاب ۱۳۵۷ فعالیت آشکار خود را آغاز و ۲۶ بهمن ۱۳۵۷ را به عنوان روز تاسیس کومله اعلام کرد.

در سال ۱۳۶۲، کومله و چند گروه و سازمان چپ ایرانی، حزب کمونیست ایران (حکا) را تاسیس کردند و کومله انقلابی زحمتکشان کردستان ایران به «کومله ـ سازمان کردستان حزب کمونیست ایران» تغییر نام داد.

در سال ۱۳۷۹ بخشی از اعضای رهبری و بدنە این حزب، با تعریف پروژەای تحت عنوان «احیای کومله» از حزب کمونیست ایران انشعاب و همان نام اولیه پیش از تشکیل حکا، یعنی «کۆمەڵەی شۆڕشگێڕی زەحمەتکێشانی کوردستانی ئێران» را برای سازمان خود انتخاب کردند.
در سال ۱۳۸۶ و در پی اختلافات داخلی این حزب، گروهی از آن منشعب و «کومله زحمتکشان کردستان» را تاسیس کردند. ‌آنها حزب خود را یک «حزب کردستانی چپ» با هدف دستیابی به «حق تعیین سرنوشت برای ملت کُرد» در کردستان ایران معرفی می‌کنند. مقر مرکزی این حزب در استان سلیمانیە اقلیم کردستان عراق است.